Funktionel medicin (fra engelsk functional medicine, hvor medicin betyder behandling mere end medicin) er en medicinsk fagretning udviklet i USA. I funktionel medicin ses kroniske sygdomme som et resultat af ændrede funktioner i kroppen. Grundparadigmet, som vi på uddannelsen til ernæringsterapeut bruger meget tid på at indarbejde, er at ændre vinkel fra diagnose til funktionsforstyrrelse. At hjælpe mennesker tilbage til sundhed kræver således en afbalancering af de dysfunktioner, der er symptomernes årsag. I ernæringsterapeutens værktøjskasse er selvfølgelig viden om kost og næringsstoffers rolle i funktionsregulering, men også motion, søvnvaner, stressbalancering og psykosociale forhold indgår i helhedsoverblikket.

Funktionel medicin forstår sygdom som et resultat af interaktionen mellem et menneskes livsstil, gener og miljø. Derfor skal enhver behandlingsplan altid tilrettelægges individuelt – to mennesker er ikke biokemisk ens.